해외에서 상품을 수입하여 한국에서 판매하는 것을 업으로 하고 있습니다. 

디지택스는 일반과세자 듀오셈 이용합니다. 

해외에서 상품 수입 통관시 관부가세를 낸 후 세관에서 수입세금계산서를 발행해주었는데, 

분개할 때에는 수입세금계산서 기반으로 상품대금을 잡지 않고 부가세와 관세 부분만 입력하고, 

상품대금은 실제로는 선금제라 상품을 만들기 전에 지불하였지만,  업체마다 다른 인코텀즈에 기반한 금액 + 환차손 계정으로 넣으려고 합니다.  (상품이 제작에 오랜 시간이 걸려서, 송금할 때와 선적시기가 몇달씩 차이가 납니다)

이렇게 되면 세관에서 발행한 세금계산서의 금액과 달라지게 되는데, 

이 때 듀오셈에서 입력할 때에는 관부가세 항목과 상품 대금은 별도로 어떻게 넣으면 될지요? 상품대금의 경우는 미착금 항목을 찾을 수 없어서 어떻게 넣어야 하나 찾고 있습니다. 

세관에서 발행한 세금계산서는 거래목록에 저장하지 않고 제가 금액을 별도 수기입력하면 될까요?

알려주시면 감사하겠습니다.